Регулярное обслуживание мембран MBR требует постоянного ухода, обычно ежечасного или ежедневного. Например, системы аэрации должны работать 24 часа в сутки, чтобы предотвратить накопление ила на поверхности мембраны. Во время работы выполняется периодическая обратная промывка, обычно каждые несколько минут или десятков минут, для поддержания стабильного потока мембраны. Этот этап представляет собой непрерывное техническое обслуживание и не предполагает простоев.
Регулярное техническое обслуживание обычно проводится еженедельно или ежемесячно. Интенсивная обратная промывка или восстановительная очистка проводится примерно каждые 1–4 недели для удаления постепенно накапливающихся органических загрязнений и твердых частиц. Если система работает с водой низкого качества или с высокой нагрузкой, частота технического обслуживания будет увеличена, чтобы предотвратить постоянный рост перепада трансмембранного давления (TMD).
Глубокое техническое обслуживание и химическая очистка обычно проводятся каждые 3–6 месяцев. Химическая очистка (CIP) использует такие агенты, как гипохлорит натрия и лимонная кислота, для удаления необратимых загрязнений. Для систем с лучшими условиями эксплуатации цикл может быть продлен до 6–12 месяцев и даже дольше. Разумные циклы технического обслуживания могут значительно продлить срок службы мембранного биореактора и поддерживать стабильные характеристики сточных вод.